snakemake(1) on Linux
The text 44de21c2d700, as Debian 13 (Trixie), Debian 12 (Bookworm), Debian 11 (Bullseye), Debian 10 (Buster), Debian 9 (Stretch) shipped it. The page shows this text now.
a Python based language and execution environment for GNU Makelike workflows
Flags it lists
-
--allow-ambiguity -
--bash-completion -
--benchmark-repeats -
--cluster -
--cluster-config -
--cluster-sync -
--configfile -
--cores -
--d3dag -
--dag -
--debug -
--detailed-summary -
--directory -
--drmaa -
--dryrun -
--force -
--forceall -
--greediness -
--gui -
--help -
--ignore-incomplete -
--ii -
--immediate-submit -
--is -
--jn -
--jobname -
--jobs -
--jobscript -
--js -
--keep-going -
--keep-target-files -
--latency-wait -
--lc -
--li -
--list -
--list-code-changes -
--list-input-changes -
--list-params-changes -
--list-target-rules -
--list-version-changes -
--lp -
--lt -
--lv -
--nocolor -
--nolock -
--notemp -
--nt -
--output-wait -
--overwrite-shellcmd -
--print-compilation -
--printshellcmds -
--profile -
--quiet -
--reason -
--rerun-incomplete -
--ri -
--rulegraph -
--snakefile -
--stats -
--summary -
--timestamp -
--touch -
--unlock -
--verbose -
--version -
-D -
-F -
-S -
-T -
-a -
-c -
-d -
-f -
-h -
-j -
-k -
-l -
-n -
-p -
-q -
-r -
-s -
-t -
-u -
-v -
-w