samtools-ampliconclip(1) on Linux

Flags it lists

• --both-ends
• --clipped
• --fail
• --fail-len
• --filter-len
• --hard-clip
• --keep-tag
• --no-PG
• --no-excluded
• --original
• --rejects-file
• --soft-clip
• --strand
• --tolerance
• -b
• -f
• -o
• -u