pxlssq(1) on Linux

Flags it lists

• --aligned
• --citation
• --freqs
• --help
• --indiv
• --labels
• --missing
• --nchar
• --nseq
• --outf
• --prot
• --seqf
• --version
• -C
• -V
• -a
• -c
• -f
• -h
• -i
• -l
• -m
• -n
• -o
• -p
• -s