gmap_build(1) on Linux
The text 02a988f0cd75, as Debian 12 (Bookworm) shipped it.
Tool for genome database creation for GMAP or GSNAP
Flags it lists
-
--altscaffold -
--circular -
--contigs-are-mapped -
--dir -
--fasta-pipe -
--fastq -
--genomedb -
--gunzip -
--kmer -
--limit-to-names -
--mdflag -
--names -
--nmessages -
--nthreads -
--revcomp -
--sort -
--transcriptomedb -
--transcripts -
-2 -
-C -
-D -
-E -
-L -
-M -
-Q -
-R -
-T -
-c -
-d -
-e -
-g -
-k -
-n -
-o -
-q -
-s -
-t -
-w