cmtk-registration(1) on Linux
The text d6c2d2ed1613, as Debian 7 (Wheezy) shipped it.
Rigid and affine registration
Flags it lists
-
--accuracy -
--auto-multi-levels -
--class-flt -
--class-ref -
--coarsest -
--cr -
--crop-index-flt -
--crop-index-ref -
--crop-world-flt -
--crop-world-ref -
--db -
--delta-f-threshold -
--dofs -
--dofs-final -
--echo -
--exploration -
--help -
--help-all -
--histogram-equalization-flt -
--histogram-equalization-ref -
--initial -
--initial-is-inverse -
--initxlate -
--man -
--match-histograms -
--mi -
--msd -
--ncc -
--nmi -
--no-switch -
--omit-original-data -
--out-itk -
--out-matrix -
--out-parameters -
--outlist -
--pad-flt -
--pad-ref -
--protocol -
--prune-histogram-flt -
--prune-histogram-ref -
--registration-metric -
--sampling -
--sobel-filter-flt -
--sobel-filter-ref -
--stepfactor -
--threads -
--thresh-max-flt -
--thresh-max-ref -
--thresh-min-flt -
--thresh-min-ref -
--time -
--verbose -
--verbose-level -
--version -
--wiki -
--write-reformatted -
--xml -
-a -
-e -
-f -
-i -
-n -
-o -
-p -
-s -
-t -
-v