bedmap(1) on Linux
The text 141e2fb98445, as Debian 11 (Bullseye) shipped it.
manual page for bedmap 2.4.39+dfsg1
Flags it lists
-
--bases -
--bases-uniq -
--bases-uniq-f -
--bp-ovr -
--chrom -
--count -
--cv -
--delim -
--ec -
--echo -
--echo-map -
--echo-map-id -
--echo-map-id-uniq -
--echo-map-range -
--echo-map-score -
--echo-map-size -
--echo-ref-name -
--echo-ref-row-id -
--echo-ref-size -
--exact -
--faster -
--fraction-both -
--fraction-either -
--fraction-map -
--fraction-ref -
--header -
--help -
--indicator -
--kth -
--mad -
--max -
--max-element -
--max-element-rand -
--mean -
--median -
--min -
--min-element -
--min-element-rand -
--min-memory -
--multidelim -
--prec -
--range -
--sci -
--skip-unmapped -
--stdev -
--sum -
--sweep-all -
--unmapped-val -
--variance -
--version -
--wmean